以「農業生態資源永續利用的領航者」為機關願景,設定活化蠶業、安全蜂業、普及生物防治、推動食農教育及建構苗栗新農業為五大策略目標,期許以百年農業為基,擴大影響層面為標,透過前瞻研發、跨域創新及精進服務,成為具有科技、生態、教育、人文及藝術等多功能的農業先鋒領航。